实际进口的乙肝疫苗和国产的乙肝疫苗，从不良反应以及免疫成功率而言，均没有明显差别。目前进口的乙肝疫苗进口是安在时，为葛兰素公司所生产，一针20mg。而国产的乙肝疫苗，一种是重组酵母细胞乙型肝炎疫苗，另一种是重组中国仓鼠卵巢细胞乙型肝炎疫苗。其中重组酵母细胞一般为10μg/针，中国仓鼠卵巢细胞疫苗一般为20μg/针。按正规免疫程序接种后，即0、1、6的免疫程序，95%的人均能够产生乙肝的保护性抗体，且抗体持续时间相对较长。
此外进口的乙肝疫苗和国产的乙肝疫苗，均会产生一般性的不良反应。如注射后可有注射位置的红肿、硬结、疼痛，同时患者可能出现发热。通常为低热，还可伴随着发热，有肌肉关节的疼痛、倦怠、乏力、头痛等不适。但上述不良反应，通常在1-3天左右就会自行消失，不需做特殊处理。