目前医学界尚未出现心肺移植后存活时间的联合结果发表，但结合心脏移植和肺移植结果考虑，5年的存活率应该是在70%-80%，更长时间没有明确的数字。但是总体上存活率不是特别理想，可以作为心脏和肺脏的终末期阶段的最后选择。
心肺移植和心脏移植的预后、手术风险不同，心肺移植比心脏移植难度更高，并且心肺移植后效果要比单纯心脏移植效果差，主要由于肺移植和心脏移植存在不同。肺移植后容易出现呼吸道感染，平时人体也容易出现呼吸道感染，如感冒、肺炎，但是心脏难以被感染。一旦肺部被感染后，通常是灾难性的后果。所以一旦合并肺移植后，预后通常会较差。