结石形成的原因主要有以下几点：
1、机体代谢异常：机体代谢异常可以导致结石形成，有些病人尿酸高，可以形成尿酸结晶，造成痛风和泌尿系统的结石。有些病人血钙升高，也可以在肾里面形成结石。有些病人胆固醇增高，会促进胆囊内胆固醇结晶、结石的生成；
2、器官异常：器官局部的因素也可能引起结石，如肾脏、输尿管的结构异常，尤其是输尿管肾盂连接部的狭窄，会造成尿液的引流排泄不通畅，尿液积聚浓缩形成结晶、结石。胆囊收缩功能减弱，也可以使胆汁淤积、浓缩，胆汁浓缩功能增强导致结石的形成；
3、药物因素：结石的形成可能与药物的使用有关，有些药物使用后在尿液中不能够充分的溶解、排出，药物结晶会在肾里面停留聚集，也会造成结石；
4、饮食、地域因素：食用过多的大豆、动物的内脏或者混着吃菠菜和豆腐，会在体内产生比较多的草酸钙，也会形成结石。在南方高温、喝水少的情况下，容易形成肾结石。