全身麻醉对身体的危害是一过性、暂时的。全身麻醉是指通过建立外周液体，通过肌肉注射静脉、吸入等情况，让病人中枢神经系统抑制反射消失、痛觉消失、肌肉松弛，从而为外科创造良好的手术环境和条件的这样一个麻醉过程。
通过麻醉，能够让病人处于无痛、舒适的状态，所以在这个过程中，常常应用的是镇静药、肌肉松弛药或者是吸入药。这些药物都是暂时、一过性、短暂地抑制大脑功能，而对于大脑只是功能的一个抑制，不会改变结构等，对大脑、身体没有什么危害。
当麻醉停止以后，药物也会立刻停止，药物在30分钟以上，或者是1-2个小时之内，会分别从肝、肾、呼吸等途径的代谢排除体外，对身体没有什么损害，也不在身体内长久存在。