肝包虫病是指肝上有包虫性占位，如果占位是由囊型包虫病引起，或由细粒棘球蚴引起，就是局限性的囊性占位，有完整的包膜。占位＞4cm时先选择手术切除，切除后再辅以肠虫清、吡喹酮等杀虫药物的长期治疗，即可达到较好的治疗效果。如果浸润范围较大，还可以选择半肝切除或肝移植，来挽救包虫引起的肝脏损伤，然后再辅以后期的药物治疗。
如果肝上的包虫，是由于多房棘球绦虫，或泡型包虫病引起。这时由于是浸润性生长，所以很难通过手术切除干净，通常采用药物杀虫的治疗方案。但由于病灶范围大，杀虫效果不佳 ，所以需长期坚持进行杀虫治疗。目前就是手术与药物治疗相结合的方案，来治疗肝包虫病，同时也可以通过肝脏部分切除、半肝切除或肝脏移植等手术干预。