霉菌性阴道炎现称为外阴阴道假丝念珠菌病，通常复方甲硝唑栓不可以治疗外阴阴道假丝念珠菌病，甚至可能导致外阴阴道假丝念珠菌病病情加重。外阴阴道假丝念珠菌病是由于白色念珠菌，感染外阴阴道所导致的局部炎症，主要症状是豆渣样白带、分泌物增多、外阴瘙痒，甚至剧烈难忍影响睡眠。临床针对其治疗需要使用抗真菌药物，如局部使用克霉唑，或口服氟康唑、伊曲康唑等。
外阴阴道假丝念珠菌病其中的原因，可能是血糖高，或使用抗生素导致局部菌群失调。而复方甲硝唑栓其中含有的甲硝唑，便属于抗生素，不仅无法治疗真菌，甚至还可能进一步加重外阴阴道假丝念珠菌病已经存在的菌群失调，即进一步杀死局部正常的菌群，如乳酸杆菌，因此不建议使用复方甲硝唑栓来治疗外阴阴道假丝念珠菌病，而是应该使用抗真菌的药物进行治疗。