如果孕妇摄入大量的EPA，不利于胎儿的生长发育。大量摄入EPA后在短时间之内可以加快心率，增加孕妇和胎儿重要脏器的负担，所以孕期不建议进行EPA的补充。
DHA是细胞膜的组成成分之一，是大脑和视网膜的重要的构成成分，也是大脑和神经系统、免疫系统、心血管系统、皮肤在发育过程中间不可缺少的物质。因为DHA可以促进大脑视觉神经细胞及神经结构的生长发育，从而改善大脑的功能，显著提高智力、记忆力、学习力等。大量研究表明，孕期补充DHA对胎儿大脑的发育有益。所以临床推荐在孕中期，即怀孕16周后和到胎儿出生6个月以内补充DHA。但是市面上有很多DHA制剂的来源不明确， 有一些深海鱼类可能含有汞等有毒重金属，损害婴幼儿的神经系统发育，所以临床推荐孕妇及婴幼儿要慎重补充鱼油，也可以从天然食物中获取DHA。
通常说的深海鱼油是深海鱼类体内的一种不饱和脂肪酸的简称，主要指EPA(二十碳五烯酸)、DHA(二十二碳六烯酸)两种鱼类油脂。不饱和脂肪酸是人体所必需的脂肪酸，EPA有助于保持血管通畅，预防血栓的发生，阻止中风或心肌梗塞的发生，清除血液中堆积的脂肪。