核磁共振是一种氢质子成像，利用磁场相应原理形成图像，一般没有危害，但是磁场很大，可以使磁卡、手表、手机失灵，把体外金属物吸住或吸走，对体内金属产生热量。所以对于体内含有金属人不能做该项检，比如体内有钢板、金属假体以及有金属牙齿的患者也需要把假牙取下。磁共振检查时间比较长，对于有空间幽闭症的患者，建议不要做磁共振检查，以免继发起其它疾病。
怀孕早期即小于3个月的孕妇，如果不是急症必须，也不建议行磁共振检查，以免造成对胎儿影响。禁忌症检查者包括体内有金属植入物、骨折后金属内固定、安装心脏起搏器、携带助听器电子耳蜗等患者，部分严重心肺 疾病患者，如房颤、室颤、心衰、严重慢性阻塞性肺炎、急性肺水肿等不适宜做需要呼吸、心率触发的腹部MRI检查。