疱疹性咽峡炎通常没有明显的阶段，如果一定要分具体的阶段，可以分为初期阶段以及疱疹出现、破溃、愈合阶段，具体如下：
1、发病初期：通常起病急骤，出现发热和咽痛；
2、疱疹出现：1-2天内会出现口腔黏膜的灰白色疱疹，疱疹通常在扁桃体前侧，也可以出现在咽腭弓、悬雍垂等部位；
3、疱疹破溃期：通常疱疹出现24小时后会破溃，形成溃疡；
4、疱疹愈合期：溃疡形成的1-5天内会愈合，整体症状在7天左右消失，症状缓解后患者会获得持久的免疫力。
综上所述，疱疹性咽峡炎初期阶段是出现症状，中间阶段会出现特定体征，也就是 口腔黏膜的灰白色疱疹，之后的阶段是灰白色疱疹破溃，最后的阶段是溃疡愈合，疾病症状可以逐渐缓解。