出血热疫苗要根据感染汉坦病毒的不同毒株决定，其注射的时间点也会不同。如果在野外地区感染流行性出血热，使用Ⅰ型出血热的疫苗，注射时间在感染的当天、感染的7天、14天、28天及6个月分别进行注射，通常为灭活疫苗。如果在家内感染出血热的病毒，可使用Ⅱ型的灭活疫苗，注射的时间在感染的当天、感染的第28天，即1个月，还有感染后的1年，注射3次即可。
Ⅰ型疫苗和Ⅱ型疫苗之间，具有相互交叉免疫的保护性。如果在野外感染后注射Ⅰ型疫苗，在家庭内再出现感染，其实有一定的交叉保护性，需要根据感染病毒的时间和感染病毒量进行判断。反 之亦然，如在家感染流行性出血热后，在野外再次感染时也要进行评估，以判断是否需要再注射疫苗。