唇裂的发病原因多种多样，目前还不是很明确，但通常有关的是以下几个方面：
1、基因的关系，若夫妻双方家族里面有唇腭裂的患者，以后出生的新生儿就有可能患唇腭裂的风险，风险较正常人要高；
2、在怀孕前期，主要是前3个月时，由于生物因素的干扰，如病毒、细菌感染，导致唇部生长融合受到阻碍，所以形成唇裂；
3、可能有药物因素的影响，若在怀孕的早期，主要是指前3个月有服药的历史，药物可能会阻断唇部组织融合；
4、物理化学因素主要是靠电池污染、X线辐射、计算机影响，可造成唇腭裂产生；
5、烟酒因素，抽烟、喝 酒也可造成唇腭裂畸形发生。
综上所述，唇腭裂的影响因素主要包括两大方面，遗传因素即自身基因的关系。环境因素即以上所述的物理、化学、药物、微生物影响，都可能导致唇腭裂的产生。