蛛网膜囊肿手术后的恢复时间根据其阶段有所不同，可以分为以下几种常见情况：
1、手术后恢复阶段：主要涉及到手术后可能会发生的相关并发症，若手术顺利、无并发症，并且恢复顺利，1-2周即可出院。由于手术存在一定的风险率以及并发症率，如可能出现出血、感染或继发脑积水等，此类患者的住院时间均会延长，部分患者甚至需要再次手术治疗；
2、出院后恢复阶段：主要涉及到囊肿消失以及脑组织的发育，若成年患者行囊肿的切除手术，该囊腔多数不会消失，因为成年患者的脑组织发育基本定型，但手术治疗可以缓解囊肿引起的相关症状，如头痛或癫痫等。对于儿童，由于脑组织发育的潜力巨大，随着囊肿切除，或囊腔与蛛网膜下腔的沟通，随着脑组织的发育，蛛网膜囊肿的空腔可能会逐渐被脑组织所充填。此外若采取囊肿腹腔分流手术，囊腔消失率也较高，但也可能后期发生分流管依赖，而需要再次手术。