如果患肠道病毒柯萨奇16型手足口，治疗方法主要有以下：
1、及时就医：及时带孩子去医院就诊，医生会给孩子做详细的体格检查，包括口腔还有全身，孩子会有相应的症状，比如有发热、感冒、流鼻涕等症状，还有嘴巴、手、脚、屁股有相应的皮疹。医生会给开具辅助检查，比如血常规、C反应蛋白、手足口的抗体、生化检测等，根据情况以及辅助检查，判断孩子是吃药还是输液；
2、治疗：对于精神状态比较好的孩子大部分是口服药物，对精神状态不好的或者感染指标很高的孩子，建议输液或者住院治疗；
3、生活护理：在生活上家长需要注意清淡流食，因为孩子在初期时，嘴巴会非常疼，吃不进去东西，需要食用清淡、软烂、好咽的食物，还要监测孩子的体温情况，护理皮疹，尽量不要让孩子去抓皮疹，抓破以免感染。如果已经破了，要用碘伏或者酒精给孩子疹子的地方消毒。
不管是感染哪一种类型的手足口病，治疗原则基本上都相同。