房间隔缺损手术成功率较高，在99%以上。房间隔缺损分为继发性房间隔缺损、原发性房间隔缺损，继发性房间隔缺损又分为分中央型和上腔型、下腔型，因其类型不同，故手术方法也不同。中央型房间隔缺损可行介入治疗，特殊类型的房间隔缺损已从体外循环下常规手术，发展到由腋下切口的微创手术，甚至发展到腔镜下的房间隔缺损修补术，创伤较小、恢复较快、美观。
很多人在体检或在婴幼儿时，可通过超声发现心脏杂音，明确诊断，可较早进行治疗。如患者年龄较大，疾病持续时间较长导致心脏功能损伤，则预后相对较差。建议一旦发现房间隔缺损，应尽早行手术治疗。