牙齿并不是实心的组织，而是空心组织，外面是比较坚硬的牙釉质、牙本质，在牙齿里面有大量的软组织，包括牙髓、牙神经、血管等。牙神经痛多数都是因为细菌侵犯到牙髓组织，引起牙髓腔内的炎症反应。出现炎症的时候，髓腔的压力很大，会压迫到牙神经引起患者剧烈疼痛。如果出现这种问题，首选根管治疗，把感染的牙髓、神经血管清除干净，然后在牙髓腔放消炎药。所以一般牙神经痛，做完根管治疗以后不会出现副作用，因为目前做根管治疗所用的器械都是严格消毒的，所用的药品比较安全，对牙齿或者对其它的口腔内黏膜刺激性都比较少。
另外，现在做规 范的根管治疗通常是在橡皮障隔离下进行操作，即通过一块布把牙齿单独隔离出来，在牙齿上面做任何治疗，都不会碰到口腔的黏膜或者牙龈等其它组织，所以一般没有不良反应。