慢性肾炎指整个病程处于慢性迁延不愈状态，不能被治愈，即使患者经过治疗，各项指标完全好转，理论上不能认为慢性肾炎完全治愈，要时刻留心进行复查。若慢性肾炎目前进入相对稳定时期，患者指标正常，是否会对以后肾脏功能造成影响，需结合慢性肾炎影响程度而定。既往慢性肾炎发作越强烈、持续时间越长，可能在肾脏中炎症波及范围越大，造成损伤也越大，修复后留下的瘢痕可能越多，而剩余有功能、没有受损的肾脏单位可能会越少。
如果患者以后再发生疾病，会导致肾功能衰竭几率增加。如果慢性肾盂肾炎患者已经得到治愈，也需注意保护肾脏功能。任何可能加重肾脏负担的因素，如高血压、高血糖、高血脂、高尿酸血症，以及肥胖、进食大量蛋白质类食物、使用肾损害药物，均会造成已经受损的肾脏组织负担加重，使疾病进展加快。如果去除上述因素，对肾脏进行有力保护，即使疾病进展可能比较接近正常人肾功能衰竭速度，可尽量延缓发展速度。