心脏射频消融术为一种相对安全的微创心脏介入手术，其并发症主要包括以下几种：
1、心包积液、心包填塞：通常由心脏穿孔所导致，发生几率较低；
2、外周血管并发症：主要是股动静脉瘘及假性动脉瘤，若瘘口较小可不进行特殊处理，患者通常可自行恢复。假性动脉瘤经局部加压包扎、适当制动，大部分患者可闭合，血肿可自行吸收，少部分患者需行外科修补；
3、栓塞：主要为外周动脉栓塞，较常见于脑栓塞、肺栓塞，整体而言栓塞发生几率较低。
室上速射频消融术，尤其间隔旁道消融术易引起房室传导阻滞，消融术后部分患者可发作迷走神经反射、血压 低、心率慢，但常为一过性表现，经积极治疗通常可恢复。