囊胚着床时常没有临床症状，但有时会有少许阴道出血，有时会有轻微腹痛，甚至个别情况下阴道出血会逐渐增多。囊胚随着阴道出血排出体外，表现为生化妊娠，但这种情况相对少见，受精卵形成后7-10天会种植于子宫内膜上着床。大部分情况下不会有临床表现，女性没有感觉。
部分女性着床时会有少许阴道出血，甚至会有轻微腹痛，属于正常生理现象，通常无需特殊干预。着床后胚胎分泌的HCG会进入女性体内，表现为血HCG升高。通常1周左右尿妊娠试验会呈阳性，从而确定妊娠。个别女性着床时会有少许出血，之后出血逐渐增多，如同来月经。之后胚胎随着 阴道出血而排出体外，表现为血HCG一过性升高，之后逐渐降至正常，属于生化妊娠的表现。