附睾头部囊肿其实是附睾头部的囊液性小病变，是良性病变，发病原理主要是由于附睾内部的管道系统发生炎性、梗阻性疾病，导致附睾内部精液排出的通道受到影响，出现狭窄、梗阻，最后造成局部的精液潴留。这种潴留精液会形成很小的囊肿，随着管道受阻时间的延长，局部瘀滞的精液量会越来越多，在临床上就会表现出体积显著增大的附睾囊肿病变。
这种病变出现后不必过于紧张，一般不超过3cm时可继续观察，尤其是微小或1cm左右的囊肿，可以不进行任何临床治疗。出现2-3cm的囊肿，个别患者可能会有阴囊部位的不适感，合并感染的情况下可能还会有局部的疼痛感觉，患者可以考虑做囊肿切除手 术解决问题。