甲状腺抗过氧化物酶抗体高，如果是单纯的抗过氧化物酶高，不需要特殊处理，取决于甲状腺功能。如果血中甲状腺功能正常，仅是抗体高，目前临床中没有特殊治疗。
有些人可能会采用补硒方式治疗，补硒后抗体可能会有所下降，停止补硒抗体还会升高。也可能是跟缺维生素D有关，但是很多患者也补充维生素D后，抗体改变也不是特别明显。
如果只是血中的抗过氧化物酶抗体高，应该不需要治疗，需不需要干预主要取决于甲状腺功能。如果甲状腺功能正常，不需要特殊参与，目前即使用很多方法，对此酶数值的高低或者抗体水平，基本没有大变化。
抗体水平变化主要取决于机体的自身免疫改变，目前针对甲状腺的过氧化物酶抗体，没有特殊治疗，但是也不会造成影响，所以不要担心。