肺癌化疗是应用具有细胞毒性的药物，在杀死癌细胞的同时对正常细胞和组织也会导致损伤，由此可以带来相应的副作用，常见的是骨髓抑制、胃肠道反应、脱发、局部刺激、过敏。
细胞毒性根据药物不同而不同，常常是限制性毒性，神经系统可以导致神经炎甚至中枢损害。博来霉素可以导致肺间质纤维化；阿霉素类可以引起心肌炎；药物从肾脏排泄会引起局部刺激；铂类药物也会引起肾损害；有些药物可以导致肝纤维化或坏死性肝炎，所以在应用化疗药物时要关注毒副反应，这些反应在近期内都可能发生。长期毒性常见的是两大类，白血病可以在两年之内发生，男女患者都有可能发生不孕不 育。