非梗阻性无精症通常难以治愈，是由于睾丸的生精功能障碍，导致无法生产精子，精液中无精子但输精管道通畅，所以称为非梗阻性无精症。导致非梗阻性无精子症的原因较多，临床上已知的原因包括隐睾、部分垂体疾病以及克氏征、卡尔曼综合征等先天性下丘脑-垂体-性腺轴疾病，部分染色体异常疾病，如Y染色体微缺失、染色体结构或数量畸形，也可导致睾丸生精功能障碍。
患者通过药物保守治疗或手术方式，也难以恢复睾丸的生精功能。非梗阻性无精子症的患者，希望可以从睾丸中找到精子进行试管婴儿，但多数患者即便通过显微取精的方式， 也无法找到精子，需通过精子库供精的方式获得后代。