肠系膜上动脉夹层的病因，主要与解剖、病变有关，具体情况如下：
1、解剖：首先是和肠系膜上动脉本身的解剖有关系。肠系膜上动脉和腹主动脉之间是一个夹角，是腹主动脉的重要分支，这个夹角比较小，所以容易出现血流的冲击，容易在起始部的地方出现损伤，出现夹层；
2、病变：和动脉粥样硬化或者是血管退化也有一定的关系。少部分病人和腹腔反复或者是慢性的炎症，或者是外伤有一定的关系。
肠系膜动脉上段夹层的危害主要是可以引起急性期破裂，或者是慢性期形成动脉瘤破裂，引起大出血，但这种情况通常较少见。更多见的是形成夹层了之后，真腔的供血，远端真正的供血减少，引起腹痛以及肠道缺血的表现，尤其是以进食后的腹痛为主，早期症状很重，但是查体的体征很轻，这种有症状的肠系膜夹层，绝大部分需要介入治疗或者手术治疗。
目前大部分采用的是微创介入治疗，球囊扩张了之后，支架植入术把真腔撑起来，保证肠系膜上动脉目标血管，也就是小肠的血液供应。