鼻内镜检查是耳鼻喉科门诊常用的检查方法，通过鼻内镜可以清晰的显示鼻腔黏膜以及鼻道内病变。急性鼻窦炎在鼻内镜下可以观察到鼻腔黏膜充血、肿胀、鼻道内脓性分泌物等，结合患者鼻塞、脓涕等临床症状，可以通过鼻内镜检查初步诊断急性鼻窦炎。对于病情较重的患者，可以辅助于鼻窦CT和鼻腔分泌物微生物检查。
慢性鼻窦炎的诊断一般是依据患者症状、鼻内镜检查、影像学检查相结合，慢性鼻窦炎的诊断依据是根据患者临床症状，如鼻塞、流脓鼻涕、头昏、头痛、嗅觉减退或者丧失，鼻内镜下可以看到鼻道内有脓性分泌物、嗅列区或者中鼻道脓性分泌物聚集，慢性鼻窦炎需要症状和体征 以及影像学检查三者相结合做出诊断。