幽门螺杆菌感染，一般复查时间是在根除治疗后，停药不少于4周，多数会在停药后4-8周进行复查。根除治疗会服用抗菌素、PPI以及铋剂，复查要求是停止使用抗菌素，或具有抗菌作用的中成药、铋剂等至少4周，PPI即兰索拉唑、雷贝拉唑、奥美拉唑、艾司奥美拉唑等药物，停药至少2周，以上药物会对幽门螺杆菌的检测，造成一定影响，导致结果出现假阴性。
复查方式一般为碳13或碳14呼气试验，若复查结果呈阴性，代表已经成功根除幽门螺杆菌，需要患者在日后的生活中，注意避免再次感染，建议家庭碗筷尽量消毒，尽量使用公筷、公勺，出去吃饭，也尽量使用公筷、公勺，切断传播途径，有效防止幽门螺杆菌再感染。若患者在规定的时间内复查，结果阳性，提示幽门螺杆菌根除失败，需要在医生的指导下，进行下一步的诊疗。