肝移植术后患者的预期生存时间，主要取决于原发疾病情况。良性肝病患者肝移植术后，5年生存率可达70%以上，10年生存率可达50%以上，即多半人群可存活10年以上。目前国际上肝移植术后存活的最长时间已超过30年，国内也有存活20年的案例。一般肝移植预后优于终末期肝病的预后，部分患者如果不及时接受肝脏移植，可能预期生命只有1年不到的时间。
并非所有肝移植患者能够长期生存，原发病为晚期肝硬化、肝癌的患者术后可能出现相关并发症，如感染，以及血管、胆道的并发症或肿瘤复发，亦或是严重的 排斥反应等，都可能增加肝移植死亡率，所以部分患者的生存时间可能不到1年。肝移植后需定期监测各个脏器功能以及有无新发肿瘤，还需长时间服用抗排斥药物，这时会降低患者的免疫功能，增加新发肿瘤以及高血压、高血脂、糖尿病的风险。