神经阻滞法的主要副作用是造成神经损伤，神经阻滞法主要用于神经病理性疼痛，且药物治疗无效后，如枕神经、坐骨神经、躯体神经的疼痛，以及癌性神经痛，经药物治疗无法达到效果，这种情况下可用神经阻滞术。神经阻滞术是用麻醉剂，混合激素，注入神经周围或神经干内，使神经传导速度减慢或终止传导，是其基本原理。
除感觉神经外，其他神经也可能造成运动神经麻痹，引起相应的肢体和肌肉瘫痪，严重时可引起萎缩。通过注射阻滞剂，疼痛可能消失，其传递感觉的功能也会消失。因此部分患者注射阻滞剂后，出现神经支配部位的麻木和不适感 ，因此对于神经阻滞法，需在综合利弊后谨慎使用。