良性的输卵管肿瘤治疗方式主要以手术为主，其它治疗方式，比如炎性包块也可通过抗生素治疗，结核性包块可通过抗结核治疗。对于恶性的输卵管肿瘤，治疗方案主要包括两大类：
1、手术后需根据病程期别的早晚，确定是继续观察、还是进行后续的辅助治疗；
2、辅助治疗主要是化疗，化疗的方案和现在常用的卵巢癌方案一样，主要是用紫杉醇类药物联合铂类药物进行化疗，通常进行6-8个疗程。根据肿瘤的遗传特点，可使用PRAP抑制剂或者靶向药物。如果肿瘤没有遗传，可追加使用靶向的血管制剂等都可明显地延长病人的生存期、降低病人的复发率。辅助治疗还可包括内分泌治疗、免疫治疗，但总体的治疗效果比较差。争取早发现肿瘤才是提高最终治愈率、减少复发的方法。