褪黑素一般并不会对月经造成直接的影响。褪黑素是一种胺类激素，这种激素由哺乳动物和人脑中的松果体分泌，可以让黑色素细胞发光，因此被称为褪黑素。
褪黑素具有促进睡眠的作用，能使人的入睡时间短、浅睡时间短、深度睡眠期长，具有一定的时差调节能力。而女性的月经是由雌孕激素来控制，正常的月经周期为28-35天，如果出现一次延迟，多数不会超过1周，可能与近期生活环境、季节变化、精神压力、情绪波动剧烈等原因有关。由于褪黑素并不会参与内分泌激素的分泌，因而不会对女性的生理周期产生直接的影响。
但如果服用过量的褪黑素，会竞争性地抑制褪黑素分泌，使自身的褪黑素分泌降低，从而影响女性的睡眠，继而引起激素分泌与调节失调，从而间接地影响到女性的月经。
如果女性月经来潮不正常，建议到医院的妇科就诊，通过性激素六项、B超等检查明确诊断。可以在平时多做慢跑、跳绳等运动，睡觉前用温水泡脚，能帮助女性保持良好的睡眠，防止褪黑素水平下降而导致睡眠质量下降，从而影响月经。