微波炉可能会杀死食物中的一些细菌，但是对于部分活性较强的细菌，可能无法起到较好的杀灭作用。使用微波炉时应注意安全，以免发生意外。
微波炉可以在短时间内升高温度，可以达到250℃及以上，对于大部分细菌具有一定的杀灭作用。但是，部分细菌活性较强，加之加热的时间不够，可能无法彻底的杀死此类细菌。
因此，微波炉虽然有杀死食物中细菌的作用，但是效果有限。如果使用微波炉加热食物之前已经发现食物存在变质、腐坏，应避免继续加热食用，以免引起恶心、呕吐以及腹痛、腹泻等胃肠道不适，甚至引起急性胃肠炎、食物中毒等疾病的发生，不利于身体健康。日常使用微波炉时，应严格遵照说明书，避免加热金属器具、鸡蛋等，以免发生火灾等意外。