甲状腺有囊肿可能是不良生活习惯、情绪异常、体内缺乏碘元素等非疾病因素导致，还可能是由于结节性甲状腺肿、甲状腺腺瘤、甲状腺癌出血等疾病因素造成。
一、非疾病因素：
1、不良生活习惯：如果长期生活不规律，经常熬夜或暴饮暴食吃垃圾食品，可能由于内分泌紊乱，会导致甲状腺出现囊肿，一般不需要特殊处理，注意改善生活习惯即可。
2、情绪异常：如果经常生活、工作压力过大，可能会导致甲状腺素分泌减少，引起甲状腺出现囊肿，建议注意调节情绪，保持心情愉悦。
3、体内缺乏碘元素：如果平时摄入的碘元素过少，可能会导致碘元素缺乏，使甲状腺激素合成过多，引起甲状腺细胞增生，出现甲状腺囊肿。平时可以通过多进食含碘的食物缓解这种情况，常见的碘元素含量高的食物有碘盐、海带、紫菜、鱼类等。
4、其他因素：像外伤、先天性因素等，也会引起甲状腺囊肿，如先天性甲状腺囊肿可能是由于胚胎发育不良导致，可进行手术切除。
二、疾病因素：
1、结节性甲状腺肿：如果促甲状腺激素的分泌性增多，或部分甲状腺滤泡对促甲状腺激素的敏感性增高，可能会导致甲状腺增生，出现长囊肿的现象。患者可以遵医嘱使用左甲状腺素钠片、盐酸普萘洛尔口服溶液等药物进行治疗。
2、甲状腺腺瘤：甲状腺腺瘤多与射线照射、促甲状腺激素过度刺激有关，可刺激甲状腺出现囊肿，囊肿多为单发，呈圆形或椭圆形。患者可以进行手术切除治疗。
3、甲状腺癌出血：如果甲状腺癌患者局部出现出血，可在局部形成淤血，从而引起甲状腺部位有囊肿。患者需要遵医嘱使用左甲状腺素钠片等药物治疗，也可手术切除。
若患者甲状腺出现疼痛，可以去内分泌科就诊，进行B超、甲状腺功能检查等。如果发现囊肿，则需积极治疗，对浅表且直径＜3cm的小囊肿可用非手术疗法，如硬化剂治疗，对于直径较大的囊肿，尤其是＞4cm的囊肿可进行全切除术治疗。