藿香正气合剂和藿香正气水的区别主要包括组成不同、作用不同、气味不同等。如存在用药需求，应在医生指导下选择相应的药物进行治疗，不可自己盲目服用，以免药不对症，延误病情。
1、组成不同：藿香正气合剂由紫苏叶、白芷、白术、陈皮、半夏、厚朴、甘草、大腹皮、大枣、生姜、桔梗、茯苓、广藿香等中药材制作而成。藿香正气水由白芷、茯苓、生半夏、甘草浸膏、厚朴、陈皮、苍术、紫苏叶油、广藿香油等中药材制作而成。并且藿香正气水比藿香正气合剂多添加了酒精。
2、作用不同：藿香正气合剂主要治疗暑湿感冒引起的头痛、身重、胸闷以及脘腹胀痛等症状。而藿香正气水主要用于治疗外感风寒、夏伤暑湿以及内伤湿滞导致的感冒症状。
3、气味不同：藿香正气合剂气味芳香，味道微苦。藿香正气水气味辛辣，味道苦涩。
4、作用特点：由于藿香正气水中添加了酒精成分，因此与藿香正气合剂相比更加有利于人体吸收，药效的发挥速度较快。但需注意，由于藿香正气水中含有酒精，因此服药后不可开车或从事高空作业，并且该药物不可与头孢类药物同时服用，以免二者 发生双硫仑反应，导致患者出现头痛、心悸等症状。此外，无论是藿香正气合剂还是藿香正气水，如果服用药物三天症状没有缓解，均应及时去医院中医内科就诊，完善望诊、问诊等，配合医生进行进一步治疗。