通常情况下，胃镜和肠镜可以一起做，这两种检查方法主要是针对消化道病变，若人们胃部出现问题，可以做胃镜来进行检查，而肠镜检查主要针对的是肠道疾病。
在做胃镜的时候，通常需要人们空腹，做肠镜时则需要清洁肠道，在清洁肠道之前，人们可以遵医嘱喝一些泻剂，肠道清洁干净以后才可以做肠镜检查，在做检查的时候中午不能吃饭、喝水。胃镜和肠镜可以分开做，但如果有检查需要，也可以一起做，不会有冲突。对于年老体弱或伴有心肺疾病的患者，不建议同时进行胃镜和肠镜检查，避免加重身体负担。
人们可以先让麻醉师注射麻药，进入麻醉状态的时候可以先做胃镜，接着再做肠镜检查，一般在做这两种检查的时候大概需要半个小时，做完检查以后要注意自身的身体情况，如果有任何异常症状都需要及时处理。
做胃镜和肠镜检查一般需要到医院的消化内科，这两种检查可以初步了解人体胃肠道是否有恶性病变，在做检查的过程当中，对于肠道黏膜和胃黏膜都可能会有一定损伤，故做完肠镜和胃镜检查以后，短时间内需要注意清淡饮食，避免摄入辛辣的食物，如辣椒、大蒜、葱、生姜等。