眼睛流脓可能是由于泪道阻塞、角膜溃疡、眼部炎症等疾病因素引起，此时需要积极在医生指导下使用药物进行治疗，以免影响眼睛的健康状况。
1、泪道阻塞：如果存在泪道阻塞可能会导致泪液无法经由鼻泪管排出，容易感染出现炎症，在炎症刺激作用下可能会引起眼睛流脓，还可能会伴有泪溢、疼痛等症状，此时可以遵医嘱口服四环素片或外用氧氟沙星眼膏等药物治疗，促使炎症消退。
2、角膜溃疡：通常是由于外伤合并感染，导致细菌、病毒等致病因子感染角膜基质，诱发炎症性反应，当坏死的角膜上皮和基质脱落会形成角膜溃疡，从而可能会引起眼睛流脓，还可能会伴有眼部异物感、流泪等症状，可在医生指导下应用阿昔洛韦滴眼液、氧氟沙星滴眼液等药物，促使炎症消退。
3、眼部炎症：比如结膜炎、角膜炎、睑腺炎、泪囊炎等疾病，当病原微生物侵入到眼睛时，会刺激局部组织出现大量脓性分泌物，导致眼部分泌物增多，出现眼睛流脓的情况。如果为细菌感染引起可遵医嘱应用妥布霉素滴眼液、氧氟沙星滴眼液等药物治疗。如果为病毒感染引起，则需要遵医嘱应用更昔洛韦滴眼液、阿昔洛韦滴眼液等药物进行治疗。
建议出现眼睛流脓的症状时，及时前往医院眼科就诊，进行裂隙灯检查、血常规检查等明确病因，遵医嘱进行对因治疗。同时在治疗期间需要做好眼部清洁、卫生，平时需要多注意休息，有利于病情恢复。