喝完藿香正气水一般不能抽烟，以免降低药物疗效，还可能会增加药物的副作用。患者在服用药物期间，应避免吸烟、喝酒，以免影响身体恢复。
藿香正气水是一种中成药，药品类型为祛暑药，有解表化湿、理气和中的功效，可用于治疗外感风寒、内伤湿滞或夏伤暑湿所致的感冒，用药后能改善头痛昏重、胸膈痞闷、脘腹胀痛、呕吐泄泻等症状，患者出现药物适应证时，可在医生指导下遵医嘱用药。
烟中含有大量尼古丁、烟焦油等多种有害物质，如果患者服用药物期间抽烟，容易导致药效降低，可能会影响药效的发挥。另外，还容易与药物中的有效成分发生冲突，产生有毒、有害物质，对身体健康造成影响。藿香正气水可用于缓解头痛等症状，烟中的有害物质，会对中枢神经系统造成一定刺激，加重患者头痛的情况。部分患者用药以后可能会出现恶心、呕吐、皮疹、瘙痒、头晕、潮红、心悸等不良反应，用药期间如果抽烟，还可能会加重药物不良反应，所以喝完藿香正气水一般不能抽烟。
如果患者使用藿香正气水期间出现不适，如腹痛、腹泻等，建议就诊于中医科，由医生进行触诊、视诊、切诊等检查，从而明确诊 断。