碘伏涂在头上对头发一般没有损害，如果头皮部位出现伤口、破损等，就可以使用碘伏进行消毒。但可能会导致头发粘连在一起，用清水清洗后，此类情况通常会得到改善。
碘伏是日常生活与临床中经常能够用到的消毒剂，可以用于局部出现的损伤、继发感染，或术前准备等，进行消毒处理，不会出现皮肤刺激症状，如疼痛等，所以对于正常的皮肤、组织都不会产生明显伤害。而且使用时的量比较少，所以也不会造成头发损伤。如果头皮出现外伤、毛囊炎等问题，就可以使用清水冲洗局部皮肤后，再用碘伏进行消毒处理。
由于碘伏并不具有清洁头发的效果，所以不可以使用碘伏洗头。如果因为频繁染发、烫发导致头发受损，可以进行头发的深层护理，通常能够得到比较明显的改善。如果在头皮部位使用碘伏后出现脱发的情况，考虑可能并非碘伏引起的，可以到医院皮肤科就诊，查明原因，常见原因包括不良生活习惯、滥用药物、脂溢性皮炎等，医生会根据患者的个人情况给出具体治疗方案。
若头皮存在破损，则恢复期间还要注意避免患处沾水，并且还要定期换药。如果伤口过大，则建议到医院由医生进行 换药处理，防止继发感染，影响伤口恢复。