含氟漱口水可能会对人体有一定害处，在常见的含氟漱口水中，一般会加入氟化钠，使用后能够保护牙齿，防止龋齿的发生。但若长时间使用，可能会导致慢性氟中毒。
含氟漱口水具有一定防龋的功效，龋齿通常是牙菌斑导致，牙菌斑属于细菌性生物膜，主要黏附于牙齿表面，而且并不能被水冲去或漱掉，使用含氟漱口水，可以通过化学反应破坏牙菌斑上的细菌性生物膜。含氟漱口水常见类型包括氟化钠漱口水、氟化亚锡漱口水、酸性氟磷酸盐漱口水等，可以与含氟牙膏交替使用，对于牙齿健康有好处。
但若长期使用含氟漱口水，比如常年使用，可能会出现慢性氟中毒，早期可有疲乏、无力、食欲减退等情况，不易被发现，严重时会出现氟斑牙或者氟骨症，表现为全身关节疼痛，甚至关节骨骼变形、腰腿痛等情况，此时则需要引起重视。
在日常生活中，若想要使用含氟漱口水，可前往口腔科就诊，完善视诊等检查了解情况。使用含氟漱口水前、后，可以再使用清水漱口，尽可能清除掉口腔内的食物残渣和软垢。虽然含氟漱口水对预防龋齿有益，但也要注意适度使用，避免使用不慎，影响身体健康。