舌下囊肿恢复后是否会复发，需要分情况讨论，通常情况下，经过彻底的手术治疗，复发的概率极低，其他情况下容易复发。
1、不会复发的情况：舌下囊肿一般可以通过舌下腺切除术进行根治，医生先分离出舌下腺，再将其切除并止血缝合，一般经7天的恢复后拆线，再逐渐恢复，最终痊愈，手术切除后极少有复发的情况；
2、会复发的情况：对于舌下囊肿，医生将囊壁切开放出囊液或穿刺吸出囊液后，可将药物放置于囊壁或将药物注射入囊腔，目的是破坏囊壁组织，使其纤维化。或者应用激光对囊壁进行烧灼、多功能手术电离子治疗或微波热凝治疗等去除舌下腺囊肿。但这些治疗都比较容易复发。
此外，舌下囊肿可以增大，在受损破溃后，可以短暂地消失，会给一些患者恢复的错觉，但囊肿依然可以再生。因此，一旦患病，还是需要系统而彻底的治疗。