盐酸羟甲唑啉和盐酸萘甲唑啉是两种不同的药物，两者的功效作用也有一定的差异，而且每个人的病症、体质不同，对这两种药物的敏感性和治疗效果也会有一定的区别，所以不能单纯说哪个好。
盐酸萘甲唑啉有滴鼻剂和滴眼剂，滴鼻剂可用于过敏性及炎症性鼻充血、急慢性鼻炎；滴眼剂可用于角膜炎、结膜炎、干眼症等。然而，盐酸萘甲唑啉可能有一些副作用，例如反跳性鼻充血、轻微烧灼感、针刺感、头晕头痛、心率加快等，并且青光眼或其他严重眼病、萎缩性鼻炎、鼻腔干燥以及对药物过敏者禁用。
盐酸羟甲唑啉有滴鼻液、喷雾剂和滴眼液，滴鼻液和喷雾剂可用于急慢性鼻炎、鼻窦炎、过敏性鼻炎；滴眼剂可用于解除过敏、干眼、游泳、烟雾、佩戴接触镜、眼疲劳等因素引起的眼部充血。然而，盐酸羟甲唑啉可能有一些副作用，如鼻黏膜及鼻甲黏膜萎缩、干燥等，正在接受单胺氧化酶抑制剂治疗的患者禁用，高血压、冠心病、甲状腺功能亢进、糖尿病患者以及孕妇慎用。
对于选择使用盐酸萘甲唑啉还是盐酸羟甲唑啉，应该根据个人情况和医生的建议来决定。用药期间注意清淡饮食，规律作息 ，适度活动，有助于身体恢复。