一般遵医嘱规范使用叶黄素无明显副作用，部分人可能会出现过敏反应，如果长期大量使用，还可能会加重肝肾负担，引起皮肤改变、胃肠道不适等。
1、过敏反应：部分人由于体质原因，尤其是过敏体质的人群，可能会对叶黄素出现过敏反应，当使用叶黄素后可出现皮疹、瘙痒、呼吸困难、腹泻等不适，需要避免再使用叶黄素。
2、加重肝肾负担：叶黄素进入体内后，也需要经过肝肾脏进行吸收、排泄，正常使用并不会加重不适症状，但长期或大量服用叶黄素，则可能会加重肝肾负担。甚至引起肝肾脏损害的严重后果，常会出现血尿、蛋白尿等情况。
3、皮肤改变：如果大量摄入叶黄素，并且在体内大量聚集，不能排出体外时可能使皮肤变黄，还可能出现黏膜发黄、尿液黄染等改变，通常停药后会消失。
4、胃肠道不适：如果对于胃肠道功能低下的人群大量服用叶黄素类药物，可能会对胃肠道造成负担，容易引起腹痛、腹泻、腹胀等不适症状。
虽然叶黄素是一种抗氧化剂，可以防止自由基和光线对眼睛的伤害，有缓解眼疲劳、保护视力等，但是不可以大量服用相关的保健 品，以防引起身体不适。平时可以多吃富含叶黄素的食物，比如菠菜、韭菜、南瓜、柑橘、枸杞、香菜等。