连花清瘟制剂和阿莫西林制剂通常能一起吃，两种药物在临床上并没有配伍禁忌。一起服用通常不会发生药物相互作用，可以起到较好的治疗效果。
连花清瘟制剂一般指的是连花清瘟颗粒、连花清瘟胶囊或者连花清瘟片，属于中成药，主要由连翘、金银花、炙麻黄、炒苦杏仁、石膏、板蓝根、绵马贯众、鱼腥草、广藿香、大黄、红景天、薄荷脑、甘草所组成，能够达到清瘟解毒、宣肺泄热的功效，可用于治疗流行性感冒引起的发热、肌肉酸痛、鼻塞流涕、咳嗽、咽干、咽痛等症状。
阿莫西林是一种西药制剂，药品类型为β-内酰胺类抗生素，常用的剂型有片剂、胶囊剂、咀嚼片、颗粒剂等，可用于治疗溶血链球菌、肺炎链球菌、葡萄球菌或流感嗜血杆菌所导致的中耳炎、鼻窦炎、扁桃体炎以及咽炎等上呼吸道感染，同时对急性支气管炎、肺炎等下呼吸道感染，也能够起到消炎作用。连花清瘟制剂和阿莫西林制剂所含药物并不冲突，通常可以一起服用，并不会对身体健康造成影响。
当患者出现药物适应证时，可前往医院内科就诊，完善血常规、喉镜等检查，在医生指导下遵医嘱服用药物，以免出现药不对症的情况。