脾肾两助丸通常应在饭前口服，由于每个患者病情严重性、体重、对脾肾两助丸吸收程度等方面存在差异，所以关于此类药物的具体使用方式，应以医生给出的为准，避免盲目使用。
脾肾两助丸内有党参、白术(麸炒)、鸡内金(炒)、土鳖虫、川芎、山药(麸炒)、熟地黄、黄芪(蜜炙)、白芍(酒炒)、茯苓、小茴香(盐炒)、山茱萸(酒制)、枸杞子、杜仲(炭)、补骨脂(盐炒)、锁阳、九节菖蒲、郁金、陈皮、半夏(制)、款冬花、麦冬、川贝母、牵牛子(炒)、牛膝、肉苁蓉、甘草(蜜炙)、泽泻、使君子仁、当归，能起到滋养脾脏、护养肝肾、补益中气等效果，可减轻脾肾虚弱诱发的没胃口、腹部胀满、腰腿酸软、耳鸣、没力气等异常表现。
通常建议在饭前服用脾肾两助丸，以防饭后口服，胃内存在食物，影响机体对药物的吸收，干扰疾病好转。处于孕期、存在实热内盛、对脾肾两助丸内中草药过敏等患者，不应口服脾肾两助丸，防止损害胎儿健康，加重头痛、发热、大便过干、咽喉干燥等实热内盛现象，或引发红疹、斑疹、呼吸加快等过敏现象。
服用脾肾两助丸的患者应避免进食烧鸡、炸串等油腻食物，可以合理进食石榴、 蓝莓、萝卜等高营养、清淡的食物，戒掉烟酒，也不要擅自搭配其他药物，避免形成相互作用。如果在口服脾肾两助丸大概2周后或在用药过程中，自身不良表现没有明显减轻或变重，应尽快停药并到医院中医科诊治。