男性备孕通常可以吃一些安全性高、副作用低的消炎药，最大限度减少对以后胚胎的影响，同时应该在医生指导下进行针对性用药处理，等病情缓解后还应该尽快停药，不宜长时间用药。
在备孕期间，如果男性自身存在炎症感染，而且病情持续不见缓解的情况下，可以遵医嘱使用消炎药进行抗感染治疗，比如头孢类、青霉素类、大环内酯类消炎药，常见的有头孢呋辛酯片、青霉素V钾片、阿奇霉素片等。此类消炎药副作用相对比较低，一般对精子影响不大，即使在用药期间意外怀孕，通常也不会致畸，对胎儿发育影响比较小。
但如果男性在备孕期间自身状态比较差，炎症比较严重，需要遵医嘱使用氨基糖苷类、喹诺酮类的消炎药，如硫酸庆大霉素缓释片、乳酸左氧氟沙星片等，则需要暂停备孕工作。此类消炎药的副作用相对比较大，可能会影响精子质量，为保证优生优育，患者需要按疗程用药，等病情得到控制，而且停药一段时间后，如1-3个月，复查体内无药物成分，再考虑开始备孕。
男性在日常生活中应该注意休息，加强体育锻炼，增强自身体质，从而降低机体感染的风险性。在备孕期间尽量不要盲目用药，特殊情况下可以遵医嘱有选择性地用药，而且用药之后需要到生殖医学科就诊，进行精子质量检查等明确身体状况。女性怀孕之后也需要按孕周进行产检，判断胎儿发育情况是否正常，排除药物对胎儿的影响。