目前对HPV感染尚无有效的杀灭药物，但经过积极治疗后多数患者可以治好。高危型HPV感染患者可通过一般治疗的方式缓解症状，也可通过药物治疗、手术治疗的方式处理。
1、一般治疗：建议高危型HPV感染的患者保持皮肤局部清洁、干燥，避免搔抓局部，还需适当运动、合理膳食，以提高身体免疫力。
2、药物治疗：可以给予保妇康栓、维A酸软膏、氟尿嘧啶乳膏、重组人干扰素α2b注射液等药物进行治疗。也可以给予抗HPV生物蛋白敷料，从而促使患者转阴、减轻症状，防止病毒继续侵害身体。
3、手术治疗：可通过手术切除包含HPV的病灶，对于已经恶变或发生淋巴结转移的患者，还需要进行扩大切除及癌变组织周围淋巴结清扫术，以彻底清除病毒。
虽然高危型HPV感染需要通过外力手段治疗，防止病毒扩散，但最终并不一定都会发生癌变，积极进行早期治疗可以有效防止进一步发展。病毒的清除绝大多数需要靠自身免疫力，要充分给予机体反应的时间，同时增强锻炼、加强营养、注意休息，对提高自身免疫力、加强病毒清除都有一定的帮助，并遵医嘱按时前往医院的皮肤性病科复查HPV-DNA检测、皮肤镜等。