治疗丝状疣的药膏有很多，不同药物的效果存在个体差异，丝状疣是人乳头瘤病毒感染引起，建议在医生指导下选择适合自己的药膏进行治疗，以取得较好的治疗效果。常用药膏有维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏、五妙水仙膏、氟尿嘧啶乳膏等。
1、维A酸乳膏：维A酸乳膏可诱导表皮增生，还可影响黑色素细胞的生成，可作用于靶细胞，调节表皮生长因子，进而加速新的结缔组织形成。部分患者用药后可能会出现红肿和灼烧感，应在医生建议下合理使用。
2、咪喹莫特乳膏：咪喹莫特乳膏属于一种免疫调节剂，能诱导皮肤组织产生多种细胞因子，进而起到抗病毒的效果，对病毒扩散具有一定抑制作用，在用药前要保持皮肤清洁。
3、五妙水仙膏：五妙水仙膏可以去除腐败的皮肤组织，进而使新皮肤组织生成，还具有一定清热解毒功效。
4、氟尿嘧啶乳膏：氟尿嘧啶乳膏可有效缓解丝状疣引起的皮肤角化过度，但可能会导致色素沉着，因此一般不建议面部涂抹。
5、其他：除上述药膏外，酞丁安乳膏、阿达帕林凝胶、水杨酸软膏、重组人干扰素α2b凝胶等药物也有一定治疗丝状疣的效果。
除了用药膏外，丝状疣患者也可以遵医嘱在皮损内注射注射用盐酸平阳霉素，或者通过激光、电灼等方法进行治疗。如果疣体比较大，还可以进行手术切除。治疗期间需注意皮肤卫生，避免搔抓患处，也不要与他人共用毛巾、脚盆、洗脸盆等私人物品，降低继发感染风险。