新型冠状病毒感染者出现扁桃体发炎时，可以在医生的指导下使用清热解毒类药物、抗病毒药物、抗生素类药物、解热镇痛类药物、止咳化痰类药物等进行治疗。感染新型冠状病毒后新型冠状病毒可能会侵犯扁桃体，导致扁桃体黏膜充血水肿，从而诱发扁桃体发炎。
1、清热解毒类药物：比如连花清瘟胶囊、金花清感颗粒等，连花清瘟颗粒具有清瘟解毒、宣肺泄热的功效，在临床上可以用于新型冠状病毒感染的常规治疗，缓解轻型、普通型新型冠状病毒感染引起的发热、咳嗽、乏力等症状。金花清感颗粒具有疏风宣肺、清热解毒的功效，可以缓解新型冠状病毒感染引起的发热、全身酸痛等不适症状。
2、抗病毒药物：比如洛匹那韦利托那韦片、利巴韦林片等，通过抑制核苷脱氢酶等作用，进而抑制病毒核酸的合成，阻止病毒复制，可以缓解新型冠状病毒感染者出现的扁桃体发炎的情况。
3、抗生素类药物：如果感染新型冠状病毒后出现细菌感染，导致扁桃体部位出现发炎，则可以在医生的指导下使用盐酸左氧氟沙星片、头孢呋辛酯片等药物，可以抑制或杀灭细菌，促进炎症消退。
4、解热镇痛类药物：比如布洛芬片、对乙酰氨基酚片等，新型冠状病毒感染者如果在恢复期间出现发热症状，并且体温超过38.5℃，可以使用解热镇痛类药物治疗。这类药物主要通过抑制前列腺素的合成，来达到解热、镇痛的目的。
5、止咳化痰类药物：比如盐酸氨溴索口服溶液、氢溴酸右美沙芬糖浆等，新型冠状病毒感染者如果在出现扁桃体发炎后出现咳嗽、咳痰症状，可以遵医嘱使用止咳化痰类药物治疗。盐酸氨溴索口服溶液能够促进呼吸道内粘稠分泌物的排出，减少黏液的滞留和分泌，从而达到降低痰液黏度的效果，氢溴酸右美沙芬糖浆通过抑制延髓咳嗽中枢来缓解咳嗽症状。
除上述药物外，新型冠状病毒感染者还可以在医生的指导下使用西瓜霜润喉片、复方草珊瑚含片、清喉利咽颗粒、清咽滴丸、清开灵颗粒等润咽喉的药物，可以缓解咽喉不适症状。新型冠状病毒感染者如果出现高热不退、呼吸困难等症状，建议及时前往医院呼吸内科或感染病科就诊，完善血常规等检查，然后在医生的指导下进行治疗。