褪黑素不能和抗生素药物、非甾体类抗炎药、消化道用药、抗血小板聚集药物等药物一起用，褪黑素药物也不建议和部分食物一起吃，以免影响药物疗效。
一、药物：
1、抗生素药物：褪黑素是人体大脑中可分泌的激素，主要是晚上分泌，可调节人体的睡眠节律，人工合成的褪黑素大多作为保健品使用，可以调节体内激素水平，改善人体睡眠质量。而抗生素药物种类很多，不排除可能与褪黑素发生药物反应的情况，因此褪黑素不能和抗生素一起吃。
2、非甾体类抗炎药：比如布洛芬，非甾体类抗炎药主要用于解热镇痛，主要通过抑制前列腺素的合成发挥作用，此类药物可能会出现嗜睡等副作用，与褪黑素一起使用，嗜睡作用会增强，而且也可能影响药物疗效。
3、消化道用药：部分患者可能存在胃肠道疾病，如应用奥美拉唑肠溶胶囊、硫糖铝等，若同时应用褪黑素可能增加胃肠负担，不利于疾病的恢复。
4、抗血小板聚集药物：如氯吡格雷，含片剂、胶囊剂，此类药物可能会破坏褪黑素，影响保健效果。
二、食物：
应用褪黑素期间建议避 免辛辣刺激性饮食以及含咖啡因成分的食物，比如辣椒、咖啡、可乐等，以免影响褪黑素在体内的作用。
建议日常不要随意服用褪黑素，若需应用其他药物建议咨询专业医生，以免产生相互作用影响药效，还会延误治疗。保健品不可作为药物治疗疾病，若出现严重的睡眠障碍，建议咨询医生，遵医嘱用药。