艾滋病咽喉痛和普通咽喉痛的主要区别在发病原因、症状、治疗方式、辅助检查等方面。当出现咽喉痛无法判断是什么原因导致，不可自行盲目用药。
1、发病原因：艾滋病一般是不洁性行为或接触艾滋病患者的血液而发生的疾病，当人类免疫缺陷病毒进入机体后，由于病毒感染和自身免疫力降低，因此在急性期就会导致咽喉部位出现感染，表现为咽喉痛的症状。普通咽喉痛一般是由于受凉、免疫力低下导致咽炎、扁桃体炎、感冒等疾病，如感冒是由于细菌或病毒感染引起的咽喉部黏膜的炎症反应，在炎症的刺激作用下出现咽喉痛。
2、症状：艾滋病急性期不仅只有咽喉痛，还伴有发热、头疼、皮疹、关节疼痛、淋巴结肿大等症状，同时由于艾滋病无法根治，因此上述症状可出现反复发作的现象。普通咽喉痛一般伴随咽部发痒、干燥、疼痛、干咳等症状，可能不伴有全身症状。
3、治疗方式：艾滋病一般需要遵医嘱进行支持治疗以及营养治疗，如遵医嘱使用依非韦伦片、奈韦拉平片等抗病毒药物，也可以遵医嘱使用富马酸替诺福韦二吡呋酯片、恩曲他滨替诺福韦片等药物抑制病毒的复制。普通咽喉痛一般需要遵医嘱使用阿莫西林胶囊、头孢氨苄胶囊等药物进行抗炎治疗，也可以遵医嘱使用醋酸地塞米松片等药物进行消肿治疗。
4、辅助检查：若通过HIV抗原检测、HIV1/2抗体检测等发现阳性，可确诊为艾滋病导致的咽喉痛。若HIV相关检查为阴性，且通过血常规检查发现白细胞计数、中性粒细胞计数等偏高，一般是普通咽喉炎。
若出现了咽喉痛并伴有头痛、肌肉酸痛等症状，可及时就诊于感染内科，通过血常规检查、HIV抗原抗体检测等检查明确病因。