不正确地使用洗鼻器会有一定概率导致中耳炎发生，如力度过大等，规范使用则一般不会。建议日常在医生指导下按照正确方法使用洗鼻器，降低不良风险。
使用洗鼻器时若是冲洗力度较大，可能会导致冲洗液瞬间冲开咽鼓管口，进入到中耳腔，造成中耳感染，导致中耳炎的发生。也可能因为洗鼻姿势不正确，比如躺着洗鼻或者洗鼻时憋气、鼓气等，都可能在冲洗过程中，出现冲洗液进入中耳腔，从而造成感染的情况。
因此，正确地使用洗鼻器较为关键，每天洗鼻对鼻炎有一定的好处，可以清除鼻腔内的分泌物、尘埃等刺激物，保持鼻腔通畅、干净且湿润。洗鼻的时候，应选择正确的体位，通常可以采用坐位，头稍前倾并稍侧向一边，洗鼻器插入上方鼻腔，轻压洗鼻器让洗鼻液以较慢的速度进入鼻腔，并从另一侧鼻腔流出，如此反复。洗鼻期间应保持正常呼吸，不要憋气，进入口腔的液体可以吐出。一般来说，正确地使用洗鼻器，水是不会进入耳朵造成中耳炎的。
如果出现了洗鼻液进入中耳腔的情况，应停止洗鼻，并观察有无不适症状。如果出现耳痛、听力下降、耳道流脓等情况，应该及时到医院耳鼻喉科就诊。