通常无症状卵圆孔未闭患者可暂时不必手术，而合并不明原因的脑栓塞、TIA的患者，则能够做手术治疗，另外有出血倾向、败血症的患者，也不建议进行手术。
1、无症状卵圆孔未闭患者：卵圆孔是胚胎发育期间的生理通道，多数与先天性心脏病有关，如果患者年龄较小或卵圆孔比较小，分流量不大，一般没有明显不适症状，可暂时不用做手术。另外3岁以下的儿童卵圆孔未闭存在一定自愈性，也可暂时不进行手术。
2、有不明原因的脑栓塞、TIA的患者：卵圆孔未闭患者合并有脑栓塞、TIA等情况时，发作时可能会诱发脑栓塞，为预防卵圆孔未闭所致血栓，患者需到医院心血管内科就诊，遵医嘱使用阿司匹林肠溶片、硫酸氢氯吡格雷片等药物进行治疗，也可采取经皮卵圆孔未闭封堵术进行治疗。
3、有出血倾向、败血症的患者：卵圆孔未闭患者如果伴有严重出血、颅内出血，或患有败血症、视网膜病变等情况，则属于手术禁忌证，此类患者不能进行手术，可能会加重病情或出现严重术后并发症等。
卵圆孔未闭患者通过积极有效的治疗后一般可控制病情，能够恢复正常生活、工作，但需要注意保持良好的生活习惯、饮食习惯，如规律作息，避免熬夜，不宜多吃辛辣、生冷的食物等。